Een voornaam kenmerk van de wind is, de niet constante manier waarop deze waait, wordt eveneens als een nadeel voor het gebruik van windenergie aangehaald. Het is daardoor namelijk onmogelijk om ten alle tijden een constant blijvende hoeveelheid elektriciteit op te wekken en zal men moeten gaan werken met een opslag van stroom welke eerder is opgewekt voor de momenten dat er geen, of onvoldoende, windenergie geproduceerd wordt. Verder komt daar nog bij dat er veel windturbines nodig zijn om voor een grote energieproductie te zorgen. Deze worden dikwijls op open plekken geplaatst waar deze doorgaans geen verfraaiing voor het landschap op zullen leveren. Door sommige tegenstanders wordt zelfs gesproken van vervuiling van het landschap door de aanleg van dergelijke windparken.
Als ander nadeel kan verder aan worden gehaald dat de windmolens en –turbines voor een groot deel op zijn gebouwd uit kunststof en staal waardoor het productieproces zeer veel geld kost. Maar ook het winnen en het verwerken van de grondstoffen kost zeer veel energie en geld waardoor dit als nadeel van het gebruik van windenergie gezien wordt. Zo moet een windturbines in de regel een half jaar in werking zijn om al deze kosten terug te kunnen verdienen.
Het neerzetten van windturbines, zeker indien dit grootschalig plaatsvindt, kan er ernstige schade aan de natuur toe worden gebracht doordat bepaalde dieren niet langer in het gebied kunnen leven waardoor de biodiversiteit ter plaatse sterk zal veranderen. Bovenal kunnen er voor vogels welke in de nabijheid van de windturbines leven gevaar lopen. Ook vleermuizen kunnen ernstige hinder ondervinden van de ontstane drukverschillen.