Daarnaast is het mogelijk dat er mos vanaf het dak in de goot terechtkomt en op die manier de doorgang van het water belemmeren net zoals zand, stof of overig vuil dat door de wind in de dakgoot wordt geblazen. De enige manier om van dit soort verstoppingen af te kunnen komen of om deze voor te blijven is door regelmatig de dakgoot goed te reinigen.
Als men zo’n karwei zelf wil gaan klaren dan kan men er het beste voor zorgen dat men op een veilige manier op een hoge ladder kan werken. Hierbij mag men in geen enkel geval naar de zijkanten gaan leunen omdat dan de kans bestaat dat men het evenwicht verliest en ten val zal komen. Wanneer de dakgoot zich op meer dan twee verdiepingen hoog bevindt dan kan men overwegen om een expert op dit vlak om hulp te vragen. In het geval van een geleidelijk aflopend of een plat dak is het misschien gemakkelijker om vanaf het dak zelf te werk te gaan. Men moet dan wel oppassen met situaties als wind, vorst of nattigheid.
Het best kan men tijdens het reinigen van de dakgoot stevige werkhandschoenen dragen: het is in een dakgoot namelijk niet ongewoon dat er uitstekende schroeven of spijkers aanwezig zijn waaraan men de handen op zou kunnen halen. Het dragen van een veiligheidsbril en een stofmasker zijn eveneens aan te bevelen wanneer men besloten heeft gebruik te gaan maken van een blazer om de dakgoot mee schoon te maken. Deze veiligheidsbril is overigens ook zonder blazer aan te raden omdat deze ervoor zorgt dat droog stof minder snel in de ogen terecht zal komen.
Het reinigen van een dakgoot kan men in twee eenvoudige stappen uitvoeren. Allereerst schept men het losse materiaal uit de dakgoot door gebruik te maken van een dunne tuinschep. Dit werkt het best op het moment dat het afval in de dakgoot een beetje vochtig is; dus niet zompig of uitgedroogd. Men kan het afval dat in de dakgoot ligt eventueel zelf wat vochtig maken met behulp van een tuinslang die men op het dak heeft gericht. De tweede stap houdt in dat men de dakgoot goed doorspoelt met de tuinslang zodra het afval uit de dakgoot afgevoerd is.