Bekende klachten bij de ziekte multiple sclerose zijn: oogklachten door de ontsteking van de oogzenuw (nervus opticus) Bijvoorbeeld centraal scotoom (gezichtsuitval), stoornis in het zien van kleur, pijn bij het maken van oogbewegingen, bleekheid van pupil en stoornissen in de uitwendige motoriek van het oog.
Maar ook klachten als misselijkheid, duizeligheid en vermoeidheid worden vaak door patiënten die lijden aan Multiple sclerose genoemd. Verder komen stijve spieren en een verzwakking van de aangezichtsspier voor bij deze ziekte net zoals sensibele stoornissen in gezicht, tintelingen, een branderig gevoel of jeuk. In het algemeen meer gevoel dan vitale uitval (bijvoorbeeld onderscheiden van warm en koud). Kenmerkend voor multiple sclerose is het symptoom van Lhermitte. Bij het buigen van het hoofd treden paresthesieën langs de armen en de rug op.
Bij de ziekte komen verder nog ataxie (coördinatiestoornissen), stuurloosheid in bewegingen (tremoren) en spasmes. Verder komt het voor dat men geen trillingen heeft in de handen op het moment dat deze in rust zijn maar wel bij beweging . Naast conststipatie, hypereflexie van de blaas en blaasatonie (niet voldoende samentrekken van de blaas) hebben patiënten die lijden aan multiple sclerose eveneens te maken met seksuele stoornissen en incontinentieproblemen.
Met name in latere (ernstigere) stadia treedt er een cognitieve achteruitgang op bij patiënten met multiple sclerose. Voorbeelden daarvan zijn: stoornissen met betrekking tot het geheugen, veranderingen van de persoonlijkheid, psychotische episoden (denkstoornissen en hallucinaties), stoornissen met betrekking tot de stemming (depressie en euforie) en intellectuele stoornissen van het abstratievermogen en de begripsvorming. Verder kent een patiënt diverse spraakstoornissen.