In sommige gevallen wordt de slechte adem echter veroorzaakt door ziekten die op een andere plaats in het lichaam aanwezig zijn zoals onder andere: een maagzweer of een ander probleem dat zich voordoet in de maag of de darmen. Maar ook een breuk (hernia) in het middenrif kan ervoor zorgen dat de adem minder aangenaam gaat ruiken. Dit geldt verder nog voor een aantal aandoeningen die betrekking hebben op de nieren en de lever.
Maar ook een ontsteking aan de luchtwegen kan in bepaalde gevallen verantwoordelijk zijn voor een vies ruikende adem. Dit heeft dan met name te maken met de bacteriën die zich in de luchtwegen bevinden en daar bepaalde stoffen afscheiden die voor de minder aangename geur verantwoordelijk zijn.
Een, wellicht minder voor de hand liggende, oorzaak van een slechte adem is diabetes, oftewel suikerziekte, In bepaalde gevallen kan men bij een patiënt die lijdt aan deze ziekte aceton ruiken in de adem. Op het moment dat de glucose namelijk door het tekort aan insuline op een dusdanig slechte manier kan worden verwerkt dat het lichaam over is geschakeld op de verbranding van vet, waarbij ketonen als bijproducten ontstaan, waarvan aceton er één is. De glucosespiegel in het bloed van de patiënt is dan vaak veel te hoog. Bij een hoge bloedsuiker en een ernstige uitdroging kan keto-acidose (een metabole acidose) met een levensbedreigende coma ontstaan. Een andere reden voor een minder fris ruikende adem bij een patiënt met diabetes is de dikwijls droge mond en droge tong van de persoon in kwestie.