Een aandoening die wel pijnlijk maar niet levensgevaarlijk of bedreigend is. Is het prikkelbare darm syndroom, de oorzaak voor deze aandoening is nog altijd niet gevonden er bestaan alleen vermoedens op basis van factoren. Pijn in de darmen kan ontstaan als door een aandoening teveel vocht wordt ontrokken aan de dikke darm. De massa in de dikke darm wordt droog en hard, er kunnen scheurtjes en infecties in de darmwand ontstaan. Infecties in de darmen kunnen ontstekingen worden. Een ontsteking in de darmen kan veel pijn veroorzaken, de ontsteking kan eenmalig zijn maar ook kunnen er chronische ontstekingen optreden. Ontstekingen zijn in de meeste gevallen de oorzaak bij pijn in de darmen. Naast de ontsteking en de pijn die deze veroorzaakt treedt ook koorts op.
Ingrijpend is de ziekte van Crohn, hierbij ontstaan zweertjes in de darmwand en in de darmen. De ziekte kan zich uitbreiden over het hele spijsverteringskanaal. De zweren kunnen door de darmwand heen groeien. Er kunnen bloedingen- en vernauwingen ontstaan door littekenweefsel. Er kan chronische diarree ontstaan en bloedarmoede. Door de aantasting van de ziekte functioneren de darmen steeds slechter waardoor de pijn in de darmen toeneemt. In sommige gevallen geneest de ziekte van Crohn spontaan. Heel vaak betekend de ziekte van Crohn echter veel en langdurig pijn in de darmen.