Acute verschijnselen bij een besmetting met Salmonella zijn misselijkheid, braken, diarree, buikkrampen, koorts en hoofdpijn. Maar een dergelijke besmetting kan eveneens chronische gevolgen hebben zoals bijvoorbeeld artritische symptomen welke zich zo’n drie tot vier weken na de acute verschijnselen aan zullen dienen. Men krijgt overigens pas klachten zo’n zes uur tot twee dagen na de besmetting met de verantwoordelijke bacterie. Hiervoor zijn slechts vijftien tot twintig cellen nodig. Hoeveel cellen er een infectie kunnen veroorzaken hangt af van de leeftijd en de gezondheidstoestand van de betreffende persoon en met welke stam men is geïnfecteerd.
De acute verschijnselen van een besmetting met Salmonella houden ongeveer één tot twee dagen aan, maar kunnen evengoed enige tijd langer duren. Dit is namelijk afhankelijk van de toestand waarin de gastheer van de bacterie zich op dat moment verkeert, de hoeveelheid cellen waarmee deze is geïnfecteerd en de karakteristieken van de stam waartoe de veroorzaker behoort.
Doordat de bacterie de darmholte binnendringt en naar het darmepitheel passeert van de dunne darm zal men last krijgen van een ontsteking. Wetenschappers hebben bewijs gevonden dat er mogelijk een enterotoxine aangemaakt wordt in de cellen van de darm.
Complicaties van Salmonella typhi en Salmonella paratyphi A, B en C veroorzaken bij mensen tyfus en tyfoïde-achtige koorts. Verschillende organen kunnen geïnfecteerd worden, wat tot een beschadiging ervan zal leiden. Salmonella septicaemia wordt dan ook in veel gevallen in verband gebracht met meerdere infecties in de organen.
Post-enteritische reactieve artritis en het Reiter’s syndroom zijn eveneens gevolgen die zijn gerapporteerd, welke vaak na ongeveer drie weken ontstaan. Reactieve artritis komt circa in twee procent van alle gevallen voor waarvan een cultuur-onderzoek uit is gevoerd. Septische artritis, die optreedt na of samen met septicaemia, komt eveneens voor maar is tamelijk moeilijk te behandelen. Een snelle herkenning van een dergelijke besmetting is in alle gevallen dan ook van belang om de kans op genezing te vergroten.