Klachten die gedurende een langere tijd aan blijven houden, bijvoorbeeld wanneer deze op basis zijn van een allergie, kunnen behandeld worden met behulp van een neusspray waarin corticosteroïden zijn verwerkt. Antibiotica werken enkel tegen een bijholteontsteking die veroorzaakt is door bacteriën. Deze zijn echter in de meeste gevallen niet noodzakelijk omdat dit soort ontstekingen in de regel door een virus veroorzaakt zijn. Op het moment dat er sprake is van bepaalde gezwellen of van anatomische afwijkingen dan kan er een operatief ingrijpen noodzakelijk zijn.
In een heleboel gevallen is een bijholteontsteking een aandoening die niet gevaarlijk is. In zeer zeldzame gevallen treden er complicaties op, bijvoorbeeld doordat de ontsteking in het het aangrenzende bot (osteomyelitis) of in het hersenvlies (meningitis) doorgaat. Hierdoor kunnen abcessen (dit zijn met pus gevulde holten) ontstaan welke niet alleen pijn doen maar eveneens ongemak zullen veroorzaken. Dit soort complicaties komen echter zeer zelden voor.
De klachten die men ondervindt van een bijholteontsteking kunnen worden verlicht door middel van het druppelen van de neus met een zoutoplossing of door een paar keer op een te stomen. Voor het stoombad gebruikt met het best alleen maar heet water zonder enige toevoeging, zoals bijvoorbeeld menthol of eucalyptus, deze stoffen kunnen immers op hun beurt weer voor een bepaalde irritatie zorgen Verder kan men beter stoppen met roken omdat dit eveneens de genezing zal vertragen.
Zodra men het vermoeden heeft dat men te maken heeft met sinusitis dan kan men in alle gevallen beginnen met het regelmatig stomen. Toch kan men beter niet te lang wachten om een juiste behandeling in gang te zetten en daarvoor eerst een arts te raadplegen zodat eventueel andere aandoeningen uit kunnen worden gesloten. Deze kan in bepaalde gevallen ook specifieke medicatie voorschrijven om de kwaal aan te pakken. Bij een bacteriële infectie zal men wellicht bijvoorbeeld antibiotica voor krijgen geschreven als behandeling.